Hizalamalar
Bir hizalama, dizileme okumalarınızdan birini referans bir genoma eşler ve eşleşen bölgeyi raporlar. Bu rehber, Genom Detayı ve Kanser Adayı Detayı sayfalarında gösterilen hizalama bilgilerini açıklar.
Hizalama nedir?
DNA'nız işlenirken kabul edilen her okuma referans dizilerle karşılaştırılır. Net bir eşleşme bulunursa GENOTURK, eşleşmenin güvenini ve onu destekleyen örnekleri birlikte referans genom üzerindeki hizalanmış aralığı kaydeder.
Hizalamalar, arka plan analiz hattı tarafından işleme tamamlandığında otomatik olarak üretilir.
Hizalama aralıkları
Her hizalama satırı şunları raporlar:
- Kromozom - referans genomun kromozomu
- Erişim numarası - referans dizinin tanımlayıcısı
- Konum - hizalanmış bölgenin başlangıç ve bitiş koordinatı
- Örnekler - bu hizalamayı destekleyen okumalar
Güven
Her hizalamanın 0 ila %100 arasında, sayfada renk kodlu gösterilen bir güven puanı vardır:
%90+ yüksek güven%70-90 orta güven%70 altı düşük güven
Yorumlar
Hizalamalara yorum ekleyerek ekibinizle içerikte sohbet edebilirsiniz. Yorum sistemi iç içe yanıtları destekler, böylece konuşmalar düzenli kalır:
- Bir iş parçacığı oluşturmak için herhangi bir yoruma doğrudan yanıt verin
- Bir hizalamadaki yorumlar hem Genom Detayı sayfasında hem de hizalanmış Kanser Adayı sayfasında
Hizalamaları nerede bulursunuz
Bir genoma açarak tüm hizalamalarını Hizalamalar bölümünde görün. Kanser Adayı Detayı sayfası da adayı üreten yeni ve eski hizalamaları aynı hizalama yorumlarıyla birlikte listeler.