Genomlar
Genom, analiz için yüklediğiniz DNA dizileme dosyalarının bir koleksiyonudur. Bu rehber, yükleme, işleme durumunu takip etme, genomlarınıza göz atma ve genom detay sayfasında gördüklerinizi anlama konularını kapsar.
Gereksinimler
Genom yüklemek aktif bir abonelik gerektirir. Henüz aboneliğiniz yoksa yükleme formu yerine yükleme sayfası 14 günlük ücretsiz denemenizi başlatmanız için bir uyarı gösterir. Planları abonelikler sayfasında karşılaştırabilirsiniz. Genom verisi depolama ayrıca planınıza dahil olan ölçüm kredilerini kullanır.
Genom verisi yükleme
Bir genom oluşturmak için bir veya daha fazla dizileme dosyası yükleyin. Yükleme sırasında şunları ayarlayabilirsiniz:
- Dosya formatı - FASTA, FASTQ ve düz metin (.txt, .csv) dosyaları desteklenir
- Birey - bu genomun ait olduğu kişi veya örnek
- Kimyasal form - örneğin DNA mı RNA mı olduğu
- Tür (takson) - örneğin türü, NCBI taksonomisine göre otomatik çözümlenir
İşleme durumu
Her genom net bir durum döngüsünden geçer:
- Yüklendi - dosyalar yüklendi ve saklandı
- İşleniyor - arka plan hattı okumaları inceliyor ve analiz ediyor
- Tamamlandı - işleme bitti ve hizalama sonuçları kullanılabilir
- Başarısız - işleme sırasında bir şeyler ters gitti; tekrar deneyebilirsiniz
Genomlarınıza göz atma
The Genomlar sayfası, tüm genomlarınızı adı, kimyasal formu, dosya sayısı, toplam boyutu, durumu ve oluşturulma tarihiyle listeler. Liste şunları destekler:
- Genom adına göre serbest metin araması
- Kimyasal form, tür (takson), durum, dosya boyutu ve oluşturulma tarihi aralığı filtreleri
- Büyük koleksiyonlar için sayfa sayfa gezinme
Bir takım aracılığıyla sizinle paylaşılan genomlar da listelenir — kendi yüklemelerinizden ayırt edebilmek için adları farklı bir renkte (zeytin yeşili) gösterilir.
Genom detayı ve okumalar
Herhangi bir genoma tıklayarak detay sayfasını açın; bu sayfa şunları gösterir:
- Kimlik bilgileri - ad, birey, tür, kimyasal form, durum ve oluşturulma tarihi
- Okumalar - bu genom için yüklenen her dizileme dosyası ve boyutu
- Hizalamalar - kromozomu, konumu, güveni ve örnekleriyle her hizalanmış bölge (Hizalamalar rehberine bakın)
- Yapay Zekaya Sor - bu genomun bağlamıyla önceden yüklenmiş bir yapay zeka asistanı
Genom silme
Bir genomu silmek, dizileme okumalarını depolamadan, hizalamalarını, bu hizalamalardaki yorumları ve bunlardan tespit edilen kanser adaylarını kaldırır.